1995年11月1日廈門市第十屆人民代表大會常務委員會第十九次會議通過。
根據2017年10月31日廈門市第十五屆人民代表大會常務委員會第七次會議《廈門市人民代表大會常務委員會關于修改〈廈門大嶼島白鷺自然保護區管理辦法〉的決定》修正。
第一條 為了加強廈門大嶼島白鷺自然保護區的建設和管理，保護廈門市市鳥白鷺，維護生態平衡，遵循《中華人民共和國自然保護區條例》和有關法律、行政法規的基本原則，制定本辦法。
第二條 廈門大嶼島白鷺自然保護區（以下簡稱自然保護區）的范圍為大嶼島、雞嶼島全部陸域和灘涂。
自然保護區應設置界標。任何單位和個人不得擅自移動和破壞自然保護區的界標。
第三條 任何單位和個人都有保護白鷺（包括巖鷺、黃嘴白鷺、大白鷺、中白鷺、小白鷺等）及其賴以生息的環境的義務，并有權對違反自然保護法規的行為進行監督、檢舉和控告。
第四條 市環境保護行政主管部門負責自然保護區的綜合管理工作，下設專門管理機構，其主要職責是:
（一）貫徹執行國家有關自然保護的法律、法規和方針、政策，開展自然保護的宣傳教育工作；
（二）擬定自然保護區規劃，實施自然保護區的建設和各項管理制度；
（三）組織環境監測，調查自然資源，并建立檔案；
（四）在不影響自然保護區的自然環境和資源的前提下，組織科學研究活動。
林業、公安、市政園林、海洋與漁業、市場監督管理等有關部門應當協助自然保護區的保護管理工作。
第五條 任何單位和個人進入自然保護區，應當遵守自然保護區的各項管理制度，服從管理。
禁止在自然保護區范圍內進行狩獵、毀鳥巢、掏鳥蛋、抓雛鳥和砍伐、燒荒、放牧、捕撈、采藥、開墾、開礦、采石、挖沙等活動以及其他破壞地形、地貌及自然生態的活動。
第六條 禁止任何單位和個人作出傷害、出售、收購白鷺等行為，違者由林業、市場監督管理行政管理部門依法予以處理。
第七條 禁止任何單位和個人擅自進入自然保護區。進入自然保護區從事科學研究活動，必須事先向自然保護區管理機構提出申請和活動計劃，經依法批準后方可進行。
禁止在自然保護區內建設與保護白鷺無關的項目和進行有損白鷺生息的活動。
第八條 一切船舶未經批準不得在大嶼島界標內停泊。任何單位和個人不得為擅自進入大嶼島者提供船只。
第九條 在自然保護區的外圍保護地帶建設的項目，不得損害自然保護區內的環境質量；已造成損害的，應當限期治理。
第十條 自然保護區管理機構及其行政主管部門可以接受國內外組織和個人的捐贈，用于自然保護區的建設和管理。
第十一條 有下列情形之一的，由市人民政府或者市環境保護行政主管部門視其貢獻大小分別給予表彰或者獎勵:
（一）保護白鷺有功的；
（二）保護自然保護區生態環境有功的；
（三）在自然保護區的管理和建設中成績顯著的；
（四）對白鷺進行科學研究成績顯著的；
（五）積極開展保護白鷺的宣傳教育工作成績顯著的；
（六）對違反本辦法的行為及時予以制止或者檢舉有功的。
第十二條 違反本辦法規定，有下列行為之一的單位和個人，由市環境保護行政主管部門責令其改正，并可以根據不同情節處以五百元以上五千元以下的罰款:
（一）擅自移動或者破壞自然保護區界標的；
（二）未經批準進入自然保護區或者在自然保護區內不服從管理的；
（三）未經批準的船舶在大嶼島界標內停泊的；
（四）為擅自進入大嶼島者提供船只的。
第十三條 違反本辦法第五條第二款規定的，除可以依照有關法律、行政法規規定給予處罰的以外，由市環境保護行政主管部門沒收違法所得，責令停止違法行為，限期恢復原狀或者采取其他補救措施，并處以一千元以上一萬元以下的罰款；給自然保護區造成損害的，責令其賠償損失；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第十四條 違反本辦法第九條規定的，由市環境保護行政主管部門責令其改正，并處以五千元以上五萬元以下的罰款。
第十五條 妨礙自然保護區管理人員執行公務的，由公安機關依照《中華人民共和國治安管理處罰法》的規定給予處罰；情節嚴重，構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第十六條 自然保護區管理人員玩忽職守、濫用職權、徇私舞弊的，由其所在單位或者上級主管機關給予行政處分；構成犯罪的，依法追究刑事責任。
第十七條 當事人對行政處罰決定不服的，可以依法申請行政復議或者提起行政訴訟。
當事人逾期不申請復議，也不起訴，又不履行處罰決定的，由作出處罰決定的機關向人民法院申請強制執行。
第十八條 本辦法自1995年12月1日起施行。
